Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms