Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms