Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms