Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms