Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms