Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM90A7PA6NKC0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms