Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms