Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U7

RNF215, RING finger protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF215Q9Y6U7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF215Q9Y6U7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF215Q9Y6U7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF215Q9Y6U7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms