Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AUP1Q9Y679 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms