Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRPRBQ9Y5M8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRPRBQ9Y5M8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPRBQ9Y5M8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms