Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 521.44■■□□□ 1.022e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.012e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.982e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 TRMT2A-211ENST00000468917 957 ntTSL 220.76■□□□□ 0.912e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 TRMT2A-210ENST00000464535 943 ntTSL 220.73■□□□□ 0.912e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.722e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 218.59■□□□□ 0.572e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 518.28■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 MAN2A2-224ENST00000560616 988 ntTSL 517.83■□□□□ 0.442e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.422e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 TRMT2A-219ENST00000494641 1060 ntTSL 317.44■□□□□ 0.382e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 MAN2A2-205ENST00000558171 790 ntTSL 516.57■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 RABL6-205ENST00000435930 3328 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 TRMT2A-220ENST00000494820 1098 ntTSL 515.92■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 RABL6-209ENST00000466096 3949 ntTSL 1 (best)15.7■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 TRMT2A-214ENST00000480460 378 ntTSL 315.05■□□□□ -02e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 MAN2A2-202ENST00000557865 2671 ntTSL 214.38□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 MAN2A2-220ENST00000560192 2469 ntTSL 1 (best)14.36□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 RABL6-207ENST00000461992 763 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.242e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.32e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.42e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 LARP1-210ENST00000519931 569 ntTSL 48.2□□□□□ -1.12e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.162e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 NCOR1-223ENST00000583226 614 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.232e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.232e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.312e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 LARP1-202ENST00000517616 501 ntTSL 54.12□□□□□ -1.752e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.583e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.323e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 BRD2-213ENST00000495733 3404 ntTSL 216.12■□□□□ 0.173e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 BRD2-212ENST00000482914 4834 ntTSL 1 (best)15.57■□□□□ 0.083e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 BRD2-206ENST00000456339 887 ntTSL 415.5■□□□□ 0.073e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 515.36■□□□□ 0.053e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 514.92□□□□□ -0.023e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 314.77□□□□□ -0.053e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 BRD2-219ENST00000607833 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.26□□□□□ -0.133e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 411.65□□□□□ -0.543e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.344e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 14e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.934e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.854e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 TLE3-217ENST00000559574 325 ntTSL 520.13■□□□□ 0.814e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 TLE3-225ENST00000561453 3719 ntTSL 514.73□□□□□ -0.054e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 WNK2-206ENST00000448039 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)23.8■■□□□ 1.45e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 DHX38-214ENST00000579387 2258 ntTSL 519.3■□□□□ 0.685e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.125e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.235e-7■■■□□ 14.7
UTP18Q9Y5J1 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.39□□□□□ -1.871e-34■■■□□ 14.6
UTP18Q9Y5J1 EIF3B-203ENST00000413917 962 ntTSL 221.42■■□□□ 1.021e-6■■■□□ 14.6
UTP18Q9Y5J1 EIF3B-204ENST00000431643 1074 ntTSL 517.83■□□□□ 0.441e-6■■■□□ 14.6
UTP18Q9Y5J1 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.299e-7■■■□□ 14.6
UTP18Q9Y5J1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.35e-9■■□□□ 14.5
UTP18Q9Y5J1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.165e-9■■□□□ 14.5
UTP18Q9Y5J1 ABHD17A-205ENST00000591351 4647 ntTSL 219.93■□□□□ 0.785e-9■■□□□ 14.5
UTP18Q9Y5J1 RPL23A-209ENST00000582736 595 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.022e-39■■□□□ 14.5
UTP18Q9Y5J1 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.41□□□□□ -2.342e-39■■□□□ 14.5
UTP18Q9Y5J1 MCM2-203ENST00000468659 557 ntTSL 422.25■■□□□ 1.151e-8■■□□□ 14.5
UTP18Q9Y5J1 MCM2-207ENST00000477668 2510 ntTSL 221.29■■□□□ 11e-8■■□□□ 14.5
UTP18Q9Y5J1 MCM2-206ENST00000474964 2847 ntTSL 218.32■□□□□ 0.521e-8■■□□□ 14.5
UTP18Q9Y5J1 MCM2-209ENST00000491422 2844 ntTSL 515.09■□□□□ 0.011e-8■■□□□ 14.5
UTP18Q9Y5J1 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-8■■□□□ 14.5
UTP18Q9Y5J1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.854e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.794e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)17.36■□□□□ 0.374e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.164e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.582e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 324.54■■□□□ 1.522e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 224.54■■□□□ 1.522e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.462e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-212ENST00000525695 907 ntTSL 523.89■■□□□ 1.412e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.372e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.282e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-216ENST00000526710 996 ntTSL 221.99■■□□□ 1.112e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.042e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 320.34■□□□□ 0.852e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-228ENST00000529832 600 ntTSL 419.65■□□□□ 0.742e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.642e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-249ENST00000533749 633 ntTSL 518.8■□□□□ 0.62e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 318.32■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 218.32■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 518.3■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 517.94■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 316.36■□□□□ 0.212e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 516.18■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.172e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-231ENST00000530306 583 ntTSL 215.68■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 415.68■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-211ENST00000525261 559 ntTSL 215.68■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 215.54■□□□□ 0.082e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-240ENST00000531770 589 ntTSL 415.16■□□□□ 0.022e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -02e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 214.52□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 14.4
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