Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH1Q9Y2L9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH1Q9Y2L9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH1Q9Y2L9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms