Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERGIC3Q9Y282 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERGIC3Q9Y282 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms