Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVW-1Q9UQF0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVW-1Q9UQF0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms