Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCA2Q9UQC9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA2Q9UQC9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms