Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SPG7Q9UQ90 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SPG7Q9UQ90 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPG7Q9UQ90 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPG7Q9UQ90 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPG7Q9UQ90 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SPG7Q9UQ90 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SPG7Q9UQ90 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SPG7Q9UQ90 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SPG7Q9UQ90 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SPG7Q9UQ90 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SPG7Q9UQ90 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SPG7Q9UQ90 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SPG7Q9UQ90 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPG7Q9UQ90 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
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