Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KCNH4Q9UQ05 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNH4Q9UQ05 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNH4Q9UQ05 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH4Q9UQ05 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms