Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC8A2Q9UPR5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A2Q9UPR5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms