Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PADI4Q9UM07 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PADI4Q9UM07 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PADI4Q9UM07 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms