Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIMKLBQ9ULI2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms