Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES3Q9UL19 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RARRES3Q9UL19 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARRES3Q9UL19 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms