Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CHIC2Q9UKJ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
CHIC2Q9UKJ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHIC2Q9UKJ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC2Q9UKJ5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC2Q9UKJ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC2Q9UKJ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CHIC2Q9UKJ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CHIC2Q9UKJ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CHIC2Q9UKJ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHIC2Q9UKJ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHIC2Q9UKJ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CHIC2Q9UKJ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CHIC2Q9UKJ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms