Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDH22Q9UJ99 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH22Q9UJ99 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH22Q9UJ99 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms