Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSFQ9UBX1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSFQ9UBX1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSFQ9UBX1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms