Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPASTQ9UBP0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPASTQ9UBP0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms