Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMG20BQ9P0W2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMG20BQ9P0W2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMG20BQ9P0W2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMG20BQ9P0W2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMG20BQ9P0W2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMG20BQ9P0W2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMG20BQ9P0W2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMG20BQ9P0W2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMG20BQ9P0W2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMG20BQ9P0W2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMG20BQ9P0W2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMG20BQ9P0W2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HMG20BQ9P0W2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HMG20BQ9P0W2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms