Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2AFY2Q9P0M6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFY2Q9P0M6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFY2Q9P0M6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms