Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATAD3AQ9NVI7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD3AQ9NVI7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD3AQ9NVI7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms