Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TDP1Q9NUW8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TDP1Q9NUW8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TDP1Q9NUW8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TDP1Q9NUW8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TDP1Q9NUW8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TDP1Q9NUW8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TDP1Q9NUW8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TDP1Q9NUW8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
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