Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ATG3Q9NT62 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATG3Q9NT62 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATG3Q9NT62 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms