Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RRP7BPQ9NSQ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
RRP7BPQ9NSQ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms