Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1GALT1Q9NS00 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1GALT1Q9NS00 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C1GALT1Q9NS00 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1GALT1Q9NS00 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1GALT1Q9NS00 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1GALT1Q9NS00 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1GALT1Q9NS00 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1GALT1Q9NS00 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1GALT1Q9NS00 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1GALT1Q9NS00 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1GALT1Q9NS00 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms