Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLE3Q9NRF9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLE3Q9NRF9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms