Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN4Q9NQP4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PFDN4Q9NQP4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN4Q9NQP4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms