Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1BQ9NQG5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1363.9 ms