Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA2

MMP25, Matrix metalloproteinase-25, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP25Q9NPA2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP25Q9NPA2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP25Q9NPA2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP25Q9NPA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP25Q9NPA2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms