Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF12AQ9NP84 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF12AQ9NP84 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms