Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC07

TMEM165, Transmembrane protein 165, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM165Q9HC07 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM165Q9HC07 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM165Q9HC07 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms