Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR41Q9HAD4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR41Q9HAD4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR41Q9HAD4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms