Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9A7

RMI1, RecQ-mediated genome instability protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMI1Q9H9A7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RMI1Q9H9A7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMI1Q9H9A7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMI1Q9H9A7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMI1Q9H9A7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms