Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TDRD3Q9H7E2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TDRD3Q9H7E2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TDRD3Q9H7E2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TDRD3Q9H7E2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TDRD3Q9H7E2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
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