Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RETREG1Q9H6L5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RETREG1Q9H6L5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RETREG1Q9H6L5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms