Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF39Q9H2S5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF39Q9H2S5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF39Q9H2S5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF39Q9H2S5 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms