Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SHANK3Q9BYB0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHANK3Q9BYB0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHANK3Q9BYB0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
SHANK3Q9BYB0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHANK3Q9BYB0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms