Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB6Q9BUF5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB6Q9BUF5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB6Q9BUF5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms