Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TIMM29Q9BSF4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMM29Q9BSF4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMM29Q9BSF4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM29Q9BSF4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms