Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C2orf88Q9BSF0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C2orf88Q9BSF0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms