Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC22CQ9BRL7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC22CQ9BRL7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC22CQ9BRL7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC22CQ9BRL7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC22CQ9BRL7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC22CQ9BRL7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC22CQ9BRL7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC22CQ9BRL7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC22CQ9BRL7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC22CQ9BRL7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC22CQ9BRL7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC22CQ9BRL7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms