Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTP3Q9BQQ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP3Q9BQQ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RTP3Q9BQQ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms