Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA1CQ9BQE3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms